Czarne okręty przybywają do Kioto, gdy szogunat chwieje się ku upadkowi. Pośród chaosu żyje Nio, chłopiec o dobrym sercu, który stoi u progu odkrycia swojego przeznaczenia. Spotyka dwóch "Miburo", Hijikata Toshizo i Okita Soji, członków grupy roninów z Mibu, którzy później staną się słynnym Shinsengumi. Z marzeniami o lepszym świecie, Nio dołącza do ich walki o obronę miasta.