Akcja "Area 88" rozgrywa się pod koniec lat 70. i na początku lat 80. XX wieku, głównie w ogarniętym wojną kraju na Bliskim Wschodzie, zwanym Królestwem Asranu. W wojnie biorą udział najemni piloci myśliwców, a ich kwatera główna znajduje się w tajnej pustynnej bazie sił powietrznych, zwanej Area 88. Obiecujący pilot liniowy Shin Kazama zostaje oszukany i zmuszony do podpisania kontraktu przez swojego "przyjaciela" Satoru Kanzakiego. Grożąc mu egzekucją za dezercję z Area 88, Shin niechętnie staje się pilotem myśliwca i próbuje odbyć swój trzyletni kontrakt. Area 88 przyciąga wszelkiego rodzaju ludzi z różnorodnymi i często ponurymi przeszłościami. Wśród innych najemników jest Mick Simon, Amerykanin, który nie potrafił odnaleźć się w normalnym życiu po służbie w czasie wojny w Wietnamie. Mick staje się najlepszym przyjacielem Shina w Area 88. Kolejną znajomą postacią w Area 88 jest McCoy, chciwy handlarz bronią, który sprzedaje najemnikom wszystko, czego potrzebują, od papieru toaletowego po plany...