시즌 1, 에피소드 1: "파일럿" - 환멸을 느낀 전직 CIA 요원 존 리스는 은둔형 억만장자 해럴드 핀치에게 발탁된다. 핀치는 테러 공격을 예측하도록 설계된 AI "머신"을 만들었지만, 피해자든 가해자든 미래의 폭력 범죄에 연루된 개인도 식별한다는 것을 밝힌다. 그들의 첫 번째 임무는 자신이 알지 못하는 부패한 경찰 조직에 얽힌 다이앤 한센 지방 검사보를 보호하는 것이다. 리스는 한센의 부패를 성공적으로 폭로하고 돌이킬 수 없이 라이오넬 푸스코 형사를 위태롭게 만들어, 그를 정보원으로 만들 수밖에 없게 한다. 에피소드는 리스가 핀치의 범죄 예방 제안을 수락하고 새로운 목적을 찾으면서 마무리된다.

시즌 1, 에피소드 2: "유령들" - 기계는 2년 전 가족과 함께 살해당한 것으로 여겨지는 10대 소녀 테레사 휘태커의 주민등록번호를 제공한다. 리스와 핀치는 수사를 통해 테레사의 아버지가 랜데일 금융과 부동산 거래를 하면서 가족 살해 청부 계약으로 이어진 것을 밝혀낸다. 리스는 킬러로부터 테레사를 구출하고, 핀치는 카터 형사에게 그녀를 맡겨 안전을 확보하고, 랜데일의 소유주인 지미 칼훈을 체포하게 한다. 핀치는 자신의 비밀을 보호하기 위해 자신의 회사에서 사직하고, 리스와 카터는 짧고 미해결된 만남을 갖는다.

시즌 1, 에피소드 3: "미션 크립" - 존 리스와 해롤드 핀치는 빚에 시달리며 전우들과 함께 은행 강도 사건에 연루된 전직 해병 조이 더반에 대한 경고를 받는다. 리스는 그 그룹에 침투하여 더반이 전사한 군인의 가족에게 돈을 보내고 있다는 것을 발견하는데, 이는 그가 군인의 죽음에 대한 자신의 역할이라고 생각하는 것에 대한 속죄 행위이다. 갱단의 마지막 강도 목표는 NYPD 증거 보관소에 있는 파일이며, 이로 인해 대결이 벌어지고 그룹의 리더인 래티머는 정체불명의 공격자에게 살해당한다. 리스는 더반에게 여자친구 피아와 함께 뉴욕을 떠나라고 조언한다. 강도 사건을 조사하던 카터 형사는 도난당한 군용 무전기를 식별하고 리스에게 초점을 맞춘다. 에피소드는 리스가 래티머의 시체를 발견하고 도난당한 증거와 관련된 "일라이어스"라는 이름을 떠올리며 끝맺는다.

시즌 1, 에피소드 4: "Cura Te Ipsum" - 헌신적인 응급실 의사인 메건 틸먼 박사는 머신에 의해 관심 인물로 식별된다. 처음에는 리스와 핀치는 그녀가 성폭행 혐의 전과가 있는 앤드류 벤튼의 표적이라고 의심한다. 그러나 그들은 틸먼의 진정한 동기를 발견한다: 여동생 가브리엘의 강간과 그에 따른 자살에 대한 벤튼에 대한 복수. 틸먼이 벤튼을 죽이려 하자 리스는 개입하여 생명을 앗아가는 도덕적 의미를 그녀에게 상기시킨다. 에피소드의 마지막 순간에 리스는 벤튼과 함께 남겨지고, 그의 손에는 총이 들려 있으며, 벤튼의 운명에 대한 모호한 선택에 직면한다. 벤튼이 살해되었는지 투옥되었는지에 대해 시청자에게 의문을 남긴다.

시즌 1, 에피소드 5: "심판" - 사무엘 게이츠 판사가 러시아 범죄 조직의 표적이 된다. 그들은 게이츠의 아들을 납치하고, 게이츠에게 그들의 돈세탁 계획에 연루된 여자를 풀어줄 것을 요구한다. 존 리스는 개입하여 결국 판사의 아들을 구출하고 갱단 구성원들이 경찰에 체포되도록 한다. 판사는 미래에 리스를 돕고 싶다는 의사를 표명하고, 리스와 핀치는 식당에서 아침 식사를 하며 점점 커지는 신뢰를 공유한다.

시즌 1, 에피소드 6: "해결사" - 리스는 의뢰인의 문제를 해결해주는 "해결사" 조이 모건의 운전사로 위장한다. 제약 회사 대표들이 살인 및 약물 사기에 연루된 내용을 담은 민감한 녹음 파일을 전달한 후 그녀를 죽이려 하자 리스는 개입한다. 조이는 사라지지만, 녹음 파일을 복사해둔다. 한편, 카터 형사는 조직 폭력배 집행자의 살인 사건을 수사하며, 말렌 엘리아스의 도난당한 사건 파일과 연관시키고 그녀의 아들 칼 엘리아스를 용의자로 지목한다. 카터는 수사관이 사망한 것을 발견하고 살인자를 추격한다. 궁극적으로, 켈러와 로슨은 그들의 범죄로 재판에 회부되고, 약물 실로셋의 개발은 보류된다. 리스는 조이에게 문제를 일으키지 말라고 경고하지만, 그녀는 그러지 않을 것임을 암시한다.

시즌 1, 에피소드 7: "목격자" - 찰리 버튼이라는 학교 선생님이 마피아의 살인 현장을 목격한 후 주요 용의자로 지목된다. 리스와 핀치는 그를 쫓는 러시아 마피아로부터 버튼을 보호하기 위해 노력한다. 버튼을 안전하게 지키려는 노력 중에 그들은 버튼이 사실은 미스터리한 범죄 보스인 일라이어스라는 것을 밝혀낸다. 일라이어스는 리스와 대면하고, 그의 목숨을 살려준 다음, 러시아 마피아 두목의 살인을 조작하여, 브라이튼 해변에 대한 그의 지배력을 확고히 한다. 리스와 핀치는 그들의 행동이 갖는 도덕적 의미와 씨름하게 된다. 에피소드는 일라이어스가 성공적으로 경쟁자들을 제거하고 그의 지배력을 확립하면서 마무리된다.

시즌 1, 에피소드 8: "적" - 전직 슈타지 요원인 울리히 콜이 자신을 배신한 옛 동료들에게 복수하기 위해 뉴욕에 도착한다. 리스는 개입하여 콜의 아내 안야가 살아있고 딸 마리가 있다는 것을 알게 된다. 콜은 리스를 고문하지만 안야를 위협하자 결국 리스에게 살해당한다. 콜의 총은 비어있었다는 것이 밝혀진다. 그는 마지막으로 가족을 본 후 죽기를 원했던 것이다. 리스가 CIA 요원이었던 과거는 카라 스탠튼과의 회상을 통해 더욱 자세히 탐구되며, 스파이 세계에 입문하게 된 계기와 **그의 새로운 작전명 "존 리스"**에 대한 내용이 자세히 묘사된다.

시즌 1, 에피소드 9: "겟 카터" - 형사 조스 카터는 범죄 조직 보스 칼 엘리아스와 부패한 경찰 조직 "HR"에 대한 수사로 인해 생명의 위협을 받게 되면서 머신의 최신 관심 인물이 된다. 리스와 핀치는 그녀를 보호하기 위해 노력하고, 리스는 마지못해 형사 푸스코의 도움을 받는다. 회상 장면에서는 아프가니스탄에서 군사 심문관으로 활동했던 카터의 과거와 정보원의 죽음에 대한 죄책감이 드러나며, 이는 그녀가 경찰에 합류하게 된 동기가 된다. 리스의 노력에도 불구하고 카터는 엘리아스에게 조종당한 정보원에게 총에 맞지만 방탄 조끼 덕분에 살아남는다. 리스는 부패한 경찰 반장과 대면하여 엘리아스에게 카터에게 더 이상의 해를 가하면 가혹한 보복을 받을 것이라고 경고한다. 에피소드는 카터가 암살 시도에서 살아남아 안전한 상태로 마무리되고, 리스는 그녀에게 혼자가 아니라고 확신시킨다.

시즌 1, 에피소드 10: "숫자 계산 (Number Crunch)" - 기계는 은행을 조사하는 국회의원의 아들이 연루된 치명적인 자동차 사고와 관련된 네 명의 개인을 식별합니다. 이 네 명의 목격자들은 사고 차량에서 백만 달러를 발견하고 나누기로 결정합니다. 킬러들이 돈을 회수하기 위해 파견되자, 리스와 핀치는 목격자들을 보호하기 위해 노력합니다. 카터 형사는 리스와의 관계에 대해 CIA로부터 조사를 받습니다. 에피소드는 카터가 처음에는 리스와 핀치에 맞섰지만, 그들이 탈출하도록 돕기로 결정하는 순간, 전직 CIA 동료인 마크 스노우에게 리스가 총에 맞는 것으로 절정에 달합니다. 핀치는 부상당한 리스를 구출하고, 카터는 그들이 안전하게 도피하도록 돕습니다.

시즌 1, 에피소드 11: "슈퍼" - 부상을 입고 휠체어에 갇힌 리스는 아파트에서 건물 관리인인 트래스크 씨라는 최신 관심 인물을 감시한다. 핀치는 트래스크가 세입자를 스토킹하고 있다고 의심하며 현장 조사를 진행한다. 그러나 트래스크는 부유한 레스토랑 운영자인 실제 스토커로부터 세입자를 보호하려는 증인 보호 프로그램 참가자로 밝혀진다. 리스는 불타는 목발을 사용하여 경보를 울려 스토커를 무력화시키고, 핀치와 세입자는 그를 제압한다. 한편, 핀치와 리스의 활동을 알게 된 카터 형사는 핀치로부터 직접 관찰할 수 있는 번호를 받는다. 이 에피소드에는 핀치와 네이선 잉그램이 머신을 개발하는 회상 장면도 포함되어 있다.

시즌 1, 에피소드 12: "유산" - 존 리스와 해롤드 핀치의 최신 관심 인물은 부당하게 유죄 판결을 받은 죄수들을 대신하여 주를 고소하는 전문 변호사인 안드레아 구티에레즈이다. 그들은 그녀가 이익을 위해 죄수들에게 누명을 씌우고 있는 가석방 담당관인 도미닉 갈루스카의 표적이 되었다는 것을 알게 된다. 한편, 핀치는 비밀리에 사망한 파트너인 네이선 잉그램의 죽음을 조사하고 있는 그의 아들 윌 잉그램을 만난다. 카터는 리스와 함께 일하기 시작하여 그와 핀치의 작전에 대한 통찰력을 얻는다. 리스는 갈루스카가 고용한 두 번째 살인 청부업자가 NYU 법학 도서관에서 구티에레즈를 죽이려 할 때 개입하여 그녀의 생명을 구하고 즉각적인 위협을 무력화시킨다. 핀치와 리스는 계속해서 비밀을 유지하며 작전을 수행하고, 핀치는 리스에게 카터에게 기계의 존재를 밝히지 말라고 경고한다. 에피소드는 리스가 구티에레즈에 대한 즉각적인 위험을 해결하고 자신의 아파트로 돌아오는 것으로 끝맺는다.

시즌 1, 에피소드 13: "근본 원인" - 리스와 핀치는 마이클 델란시 하원의원 암살 누명을 쓴 건설 관리자 스콧 파월을 조사한다. 델란시의 예산 삭감으로 일자리를 잃은 파월은 복수를 계획했지만, 델란시의 선거대책본부장인 피트 매서슨에게 함정에 빠졌다. 핀치는 매서슨의 부패를 밝히기 위해 이전 "관심 대상"이었던 조이 모건의 도움을 받는다. 매서슨은 폭로되고 자살하며, "루트"로 알려진 미스터리한 해커가 핀치에게 연락하여 자신을 강력한 상대로 드러낸다. 리스와 파월은 암살자로부터 탈출하고, 파월은 자수하며, 핀치가 확보한 증거로 누명을 벗는다. 에피소드는 핀치가 서재에서 루트로부터 직접적인 통신을 받는 것으로 마무리되며, 루트는 자신을 밝히고 미래의 만남을 기대한다고 표현한다.

시즌 1, 에피소드 14: "늑대와 새끼" - 리스는 마지못해 동생의 살인에 대한 복수를 추구하는 십대 대런 맥그레이디의 사건을 맡게 된다. 리스는 대런이 가해자들을 죽이는 것을 막고, 대신 그가 새로운 가정을 찾고 음악 교육을 받을 수 있도록 돕는다. 한편, 핀치는 네이선 잉그램의 아들 윌이 아버지의 과거를 조사하면서 핀치의 이름에 두려움을 느끼는 여성에게 이르게 되자 걱정한다. 푸스코는 핀치가 네이선 잉그램과 함께 MIT 시절에 사용했던 가명, 해롤드 렌을 발견한다. 에피소드는 해커가 시스템을 침입하여 단순히 활동을 감시하기로 결정하면서 마무리된다.

시즌 1, 에피소드 15: "블루 코드" - 리스는 마약 밀수 조직에 침투하여 표적인 마이클 케이힐이 위장 경찰임을 알게 된다. HR 조직의 일부인 부패한 NYPD 경찰관들이 연루된 것으로 밝혀지고, 핀치는 푸스코에게 케이힐의 파일을 파기하도록 지시한다. 푸스코는 정보원으로 밝혀진 데이비슨 형사에게 붙잡힌다. 리스는 밀수업자들을 조종하여 케이힐을 보호하고, 그 결과 리스는 총에 맞아 죽도록 버려지지만 탈출한다. 에피소드는 리스의 압박을 받은 푸스코가 부패 경찰들에게 빚을 지기 위해 살인죄를 뒤집어쓰기로 동의하면서 마무리되며, HR과의 더 깊은 연루를 확고히 한다.

시즌 1, 에피소드 16: "위험 (Risk)" - 머신은 리스와 핀치를 아담 사운더스에게 안내한다. 그는 엘리아스가 조작한 수백만 달러 규모의 내부자 거래 사기에 연루된 월스트리트 트레이더이다. 사운더스는 상사 사망의 누명을 쓰고 암살 대상으로 지목된다. 리스는 사운더스를 보호하며, 그의 과거를 떠올리게 하는 노숙자들 사이에 숨긴다. 핀치는 자신의 금융적 통찰력을 활용하여 사기에 맞서 싸우고, 엘리아스의 연루 사실을 폭로하고 그의 부패한 동료를 체포한다. 사운더스는 누명을 벗고, 핀치는 수익금을 사용하여 운영을 확장한다. 에피소드는 리스와 핀치가 그들의 작전 기지로 돌아오는 것으로 마무리된다.

시즌 1, 에피소드 17: "Baby Blue" - 머신은 6개월 된 아기, 레일라 스미스를 다음 관심 인물로 식별한다. 리스와 핀치는 보호 역할을 맡아 레일라의 어머니가 상사의 아내에게 살해당했고, 그 후 아기를 납치하기 위해 폭력배를 고용했다는 사실을 발견한다. 레일라가 납치되자, 리스는 레일라의 안전한 귀환을 위해 지아니 모레티의 위치를 알려주는 대가로 엘리아스와 거래를 해야 한다. 이 행동은 카터 형사와의 불안정한 동맹을 깨뜨리고, 시만스키 형사가 총에 맞아 카터는 리스와 핀치로부터 거리를 두게 된다. 레일라는 결국 조부모와 재회한다.

시즌 1, 에피소드 18: "정체성 위기" - 핀치와 리스는 디지털 발자국이 거의 없는 인물을 조사하던 중, 두 사람이 동일한 이름, 사회 보장 번호, 은행 계좌를 공유하고 있다는 것을 발견한다. 한 명의 조던 헤스터는 신분 도용범이자 엑스터시 판매자이고, 다른 한 명인 남성 조던은 자신의 삶을 되찾으려 한다. 여성 조던에게 엑스터시를 투약당한 핀치는 웃기게도 무력화되고, 리스와 남성 조던은 협력하여 범죄자를 폭로한다. 여성 조던은 체포되고, 푸스코 형사는 신분 도용으로 인해 마약 거래 혐의로 부당하게 기소된 무고한 남자의 누명을 벗기는 데 성공적으로 도움을 준다. 한편, 카터 형사는 리스를 잡는 데 도움을 주겠다는 FBI의 제안에 고심한다. 핀치가 회복되면서 그는 리스를 "네이선"이라고 부르며 그의 과거를 암시한다.

시즌 1, 에피소드 19: "살과 피" - 머신은 뉴욕 범죄 조직 두목 다섯 명을 요주의 인물로 식별하고, 이는 칼 엘리아스가 경쟁자들을 제거하려는 계획을 암시한다. 엘리아스는 카터 형사의 아들 테일러를 납치하여 그녀의 협력을 강요하며 갈등을 고조시킨다. 리스는 개입하여 테일러와 살해당한 두목의 적자인 지아니 모레티 주니어를 구출한다. 핀치는 엘리아스가 HR 가족을 표적으로 삼는 전술을 밝히고, 부패한 경찰관들이 지원을 철회하게 만든다. 엘리아스는 체포되지만, 감옥에 가기 전에 아버지와 이복형인 지아니 모레티 시니어와 주니어를 살해하는 차량 폭탄 테러를 계획한다. 리스와 카터는 테일러를 구하기 위해 협력한 후 불안한 동맹을 재확인한다. 에피소드는 엘리아스가 구금된 채 권력 통합이라는 목표를 대부분 달성하고, 리스가 카터에게 그녀를 보호하기 위한 무기 은닉처를 주는 것으로 마무리된다.

시즌 1, 20화: "Matsya Nyaya" - 현재, 존 리스는 장갑차 경비원으로 위장 잠입하지만, 그가 보호해야 할 대상인 토미 클레이에게 배신당하고, 토미는 백금을 훔치려 한다. 토미의 여자친구 애슐리가 개입하여 토미를 죽인다. 린치 반장을 포함한 부패한 HR 경찰들이 백금을 압수하기 위해 도착하고, 린치는 애슐리를 죽인다. 푸스코가 개입하여 리스를 구하기 위해 린치를 쏜다. 한편, 회상 장면에서는 리스와 그의 CIA 파트너 카라 스탠튼이 노트북을 회수하기 위해 중국 오르도스에서 임무를 수행하는 모습이 드러난다. 그들은 프로그래머들이 죽었고, "기계"와 관련된 모든 사람을 제거하기 위해 파견되었다는 것을 발견한다. 카라는 리스를 쏘고, 둘 다 폭격에 휘말리지만, 리스는 탈출한다. 에피소드는 스노우 요원과 CIA가 사망한 것으로 추정되는 카라 스탠튼이 살아있는 것을 발견하면서 마무리되며, 미래의 갈등을 예고한다.

시즌 1, 에피소드 21: "많은 행복이 돌아오기를" - 리스의 생일에, 핀치는 그에게 하루 휴가를 주려고 하지만, 머신의 최신 관심 대상인 사라 제닝스는 그녀의 학대적인 미국 보안관 남편, 브래드에게 쫓기고 있다. 회상 장면에서는 리스의 전 여자친구인 제시카 아른트가 학대적인 남편 피터 아른트에 의해 실수로 살해당했으며, 그는 그것을 교통사고로 위장했다는 것이 밝혀진다. 리스에 대한 카터의 조사는 그녀가 제시카의 죽음에 대한 진실을 밝혀내도록 이끈다. 리스는 브래드 제닝스와 맞서 그를 무력화시켜, 그가 다시 사라를 해칠 수 없도록 한다. 에피소드는 피터 아른트와 브래드 제닝스 모두 멕시코에 수감된 채 마무리되고, 핀치는 리스에게 새로운 아파트를 제공한다.

시즌 1, 에피소드 22: "선의의 행동" - NSA 분석가 헨리 펙은 정부의 감시 프로그램인 '머신'의 증거를 발견하고 표적이 된다. 존 리스는 개입하여 펙을 암살자로부터 보호한다. 핀치는 펙을 만나 자신이 머신을 만들었다고 밝히고 그의 위험한 지식으로부터 벗어나도록 새로운 신분을 제안한다. 알리시아 코윈이 핀치와 펙의 대화를 감시하고 있는 것으로 드러나며, 그녀가 머신의 존재와 핀치의 연루를 알고 있음을 암시한다. 플래시백은 핀치와 그의 파트너 네이선의 과거, 그리고 머신의 안전 장치에 대한 그들의 다른 견해를 보여주는데, 네이선은 핀치의 의사에 반하여 안전 장치를 만든다. 리스는 또한 핀치가 보호하기 위해 거리를 두었던 핀치의 과거 사랑인 그레이스에 대해 알게 된다. 에피소드는 코윈이 머신을 알고 있다는 사실이 새로운 위험 요소를 더하며 핀치와 리스가 그들의 임무를 계속하는 것으로 마무리된다.

시즌 1, 에피소드 23: "방화벽 (Firewall)" - 존 리스와 해롤드 핀치는 HR의 표적이 된 심리학자 캐롤라인 튜링을 보호하는 임무를 맡게 된다. 리스는 튜링에게 접근하기 위해 환자로 위장하지만, 곧 HR 암살자들과 FBI 타격팀 사이에 갇히게 된다. 핀치는 조이 모건의 도움을 요청하고, 카터 형사와 푸스코 형사는 자신들이 모두 핀치와 리스와 협력하고 있다는 사실을 알게 되어 리스와 튜링의 탈출을 돕기 위해 힘을 합친다. 핀치는 튜링을 만나기로 하지만, 앨리시아 코윈과 마주치고 그녀는 핀치에게 기계를 멈추라고 요구한다. 그러자 튜링은 자신이 "루트"이며, 핀치를 유인하기 위해 이 모든 사건을 계획한 해커라고 밝히고, 곧 코윈을 살해한다. 핀치는 루트에게 납치되고, 리스는 코윈의 시신을 발견하고 공공 감시 카메라로 향해 기계에게 직접 핀치를 찾는 데 도움을 요청한다. 근처에서 공중전화가 울리고, 리스는 전화를 받는다.

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