이누카미!는 자신의 의무에 대한 태도로 인해 클랜에서 실패자로 여겨지는 이누카미 조련가 가문의 후손인 카와히라 케이타를 중심으로 전개됩니다. 이누카미는 문자 그대로 "개 신"을 의미하며, 영적인 힘을 지닌 자애로운 존재들입니다. 이들은 개의 모습을 하고 있으면서 인간 형태로 변신할 수 있는 일종의 악마입니다. 역사적인 이누카미 조련가 클랜의 파트너와 함께 그들은 악을 제거하고 정의를 확산시키기 위해 행동합니다. 케이타는 처음에는 유대감을 형성할 이누카미를 찾지 못하지만, 결국 아름다운 이누카미 요코가 그의 이누카미가 되기로 결심하면서 케이타는 기뻐하게 됩니다. 그러나 그녀가 매우 문제적이고 통제할 수 없는 이누카미라는 사실을 알게 되면서 그의 기쁨은 오래가지 못합니다. 그 이후로 케이타의 삶은 끝없는 수치로 가득 차게 됩니다.