카나메 치도리는 현대 일본의 평범한 10대 소녀입니다. 적어도, 그녀는 소우스케 사가라라는 소년이 그녀를 따라다니기 시작하기 전까지 그렇게 생각했습니다. 그는 완전히 편집증에 걸린 군사 괴짜처럼 행동합니다! 그녀의 수학여행이 납치되어 북한으로 끌려가고, 카나메가 납치되어 '휘스퍼드'라는 존재라고 알려지면서 상황이 설명되기 시작합니다. 휘스퍼드는 유전적 변이로 태어난 존재로, 수학, 과학, 기술에 대한 방대한 지식을 가지고 있습니다. 소우스케는 그녀를 구출하러 오고, 그는 세계를 보호하고 휘스퍼드가 테러리스트에 의해 악용되지 않도록 지키는 비밀 군사 조직 미스릴의 훈련된 전문가임을 밝혀냅니다. 이제 그녀가 어떤 존재인지, 소우스케가 무엇을 하러 온 것인지 알게 된 카나메는 고등학교를 무사히 졸업할 수 있을까요?