モリアーティの手にかかり、親友であり相棒であったシャーロック・ホームズが亡くなってから1年後のロンドン。ジョン・ワトソン博士は、稀な疾患を治療するためのクリニックの院長として、医師としてのキャリアを再開する。しかし、ワトソンの過去は彼を放っておかない――モリアーティとワトソンは、1世紀以上にわたり観客を魅了してきた物語に、新たな一章を刻むことになる。ワトソンは、歴史上最も偉大な探偵の一人の現代版が、犯罪捜査から、人生を脅かす最大の謎、すなわち病とその影響へと焦点を移す、医療ドラマでありながらも、確固たる捜査の要素を持つ作品である。