医学校を卒業したばかりの新米医師、ジョン「J.D.」ドリアン、彼の親友クリストファー・ターク、そしてエリオット・リードは、セイクリッド・ハート病院でインターンシップを始めます。そこで彼らは、厳格な医学部長ボブ・ケルソ博士、J.D.の渋々のメンターであるペリー・コックス博士、看護師カルラ・エスピノーザ、そしてずる賢くいたずら好きな清掃員と出会います。また、病院には宗教的な看護師ラヴァーン・ロバーツ、無能な弁護士テッド・バックランド、そしてコックスの元妻でもある意地悪な理事ジョーダン・サリバンなど、セイクリッド・ハートのスタッフたちの多様な個性が揃っています。他にも、ハイファイブをするトッド・クインランや神経質なダグ・マーフィーなどのインターンも登場します。次の9年間、彼らは個人的および職業的な高低を経験し、医者としての忙しい仕事はもちろん、人生を一人では乗り越えられないことを実感していきます。