『ザ・プリズナー』は、六番（シックス）という男が、どのようにしてそこに来たのか全く記憶がないまま、神秘的で超現実的な場所「ザ・ヴィレッジ」に閉じ込められて目覚める物語です。彼は新しい環境を必死に探索する中で、ヴィレッジの住人たちは番号で識別され、以前の存在についての記憶を持たず、常に監視されていることを発見します。このヴィレッジは、一人の男、陰険で魅力的な「ツー」によって支配されています。シリーズを通じて、シックスとツーは知恵比べを繰り広げ、シックスはヴィレッジの抑圧的な性質に挑戦し、その背後にある真実を知ろうと奮闘します。