極東、2071年。狂神たちの領域。2050年代初頭、未知の生命体「オラクル細胞」が地球上のすべての生命を制御不能に消費し始める。その貪欲な食欲と驚異的な適応力は、最初は恐怖を、次に畏敬を、そして最終的には「アラガミ」という名をもたらす。従来の武器に完全に免疫を持つ敵に直面し、都市文明は崩壊し、人類は日々絶滅へと追いやられていく。人類には一筋の希望が残されている。「神の弓」と呼ばれる、オラクル細胞を取り込んだ生きた武器の開発に続き、その使い手たちはエリート部隊に編成される。狂神たちに荒廃した世界で、これらの「ゴッドイーター」は必死の戦争を戦う。