この物語の主人公、先導アイチは、中学3年生の内気な少年。彼は目立たないように、前を向くのではなく後ろを振り返りながら生きてきた。しかし、彼を支え続けたものがあった――それは、幼い頃に貰ったカードゲームのカード、「ブラスター・ブレード」。そのカードが、彼の人生を劇的に変えることになるカードファイトの世界へと彼を導くことになる。カードゲームの名は「カードファイト!! ヴァンガード」。ゲームは「クレイ」という異世界を舞台に、かつてないプレイシステムにより世界中で人気を博していた。ヴァンガードに魅せられたアイチは、戸倉ミサキや葛木カムイといった仲間たちや、ライバルたちと出会う。彼らとの切磋琢磨を通して、アイチは充実した日々を送り始める。しかし、アイチには目標があった。それは、かつて戦ったことのある、あるヴァンガードファイターと再び戦うことである。