Whiskey Cavalier segue le avventure dell'agente dell'FBI Will Chase (nome in codice: Whiskey Cavalier) che, dopo una rottura sentimentale, viene assegnato a lavorare con l'agente della CIA Francesca "Frankie" Trowbridge (nome in codice: Fiery Tribune). Insieme, guidano un team inter-agenzia di spie che periodicamente salvano il mondo (e se stessi) mentre navigano le tortuose strade dell'amicizia, del romanticismo e delle politiche d'ufficio.