The Passage si concentra sul Progetto NOAH, una struttura medica segreta dove gli scienziati stanno sperimentando un virus pericoloso che potrebbe portare alla cura di ogni malattia, ma che ha anche il potenziale per spazzare via la razza umana. Quando una giovane ragazza viene scelta per essere una cavia, un agente federale ha il compito di portarla, ma alla fine, diventa il suo padre surrogato, determinato a proteggerla a qualunque costo, anche mentre il lavoro del Progetto Noah minaccia di scatenare un'apocalisse inimmaginabile.