A causa dei suoi scarsi voti, Tsukune Aono, uno studente liceale qualunque, non è riuscito ad essere ammesso in nessun'accademia privata di sua scelta. Per un eccezionale incidente, l'unica scuola ad accettarlo si rivela essere tutt'altro che ordinaria; la scuola è frequentata da youkai travestiti da umani. Temendo per la sua vita, tenta la fuga solo per incontrare Moka Akashiya, una bellissima ragazza che si dà il caso sia una vampira. Nonostante ciò, Tsukune decide di rimanere all'accademia, nascondendo la sua natura umana a studenti e insegnanti. Tsukune scopre anche che quando il rosario intorno al collo di Moka viene rimosso, la sua vera natura emerge.