I cuori di queste giovani ragazze sono puri, e poi violenti! Mato Kuroi ha appena iniziato le scuole medie e, il primo giorno, qualcuno attira la sua attenzione: la sua compagna di classe Yomi Takanashi. Le due si incontrano. L'innocente e ingenua Mato. La matura Yomi. Apparentemente opposte, ma il tempo che trascorrono insieme non fa che rafforzare un'amicizia crescente. Ma quando entrano nel secondo anno di scuola, vengono assegnate a classi separate e iniziano a distanziarsi. Ma da qualche parte, contemporaneamente... In un altro mondo, una giovane ragazza, con fuoco blu negli occhi, Black Rock Shooter affronta un'altra giovane ragazza; questa impugna una falce nero corvino, Dead Master, e una battaglia all'ultimo sangue inizia a svolgersi.