Mike Fukanaga mengira menghadapi sahabatnya yang suka bercanda, Owen Reynolds, dan berusaha memenangkan hati pujaan hatinya sejak lama, Amanda McKay, akan menjadi tantangan terbesar di SMA. Ternyata dugaannya salah besar. Ketika Mike mengetahui bahwa ia berasal dari garis keturunan ninja, ia pun diantar ke dunia seru pemberantasan kejahatan, adu jotos, dan pertempuran melawan penjahat. Mike & Owen bersatu sebagai "Supah Ninjas" dan mulai berlatih dengan kakek Mike alias "Hologramps." Sayangnya, ini tidak semudah kedengarannya -- di antara drama di sekolah dan melawan penjahat super, para Supah Ninjas ini akan menghadapi pertarungan yang sangat berat.