Di Jepang Feodal, penduduk Edo dikepung oleh serangga raksasa yang merusak negeri. Rakyat memohon dengan putus asa agar pemerintah melakukan sesuatu. Maka didirikanlah Kantor Hakim Serangga, yang mengumpulkan para prajurit tangguh untuk membela diri dari serangan hama. Mushibugyou mengikuti Jinbee Tsukishima, seorang pemuda yang bercita-cita menjadi ahli pedang ulung seperti ayahnya. Untuk menebus insiden mengerikan yang terjadi karena kesalahannya, Jinbee berusaha menggantikan ayahnya sebagai anggota Kantor Hakim Serangga. Dalam perjalanannya ke sana, ia bertemu Haru yang manis, seorang wanita muda yang membantu mengelola kedai teh keluarganya, dan terpaksa menggunakan pedangnya untuk menyelamatkannya dari nasib buruk. Tindakan keberanian ini membuatnya mendapatkan tempat di Kantor Hakim Serangga. Akankah pembasmi serangga pemula ini mampu membebaskan negeri dari gerombolan serangga yang menyerbu?