Yoshimori Sumimura, seorang siswa SMP berusia 14 tahun, adalah seorang Kekkaishi, pembasmi monster. Dia bersaing dengan Tokine Yumikura untuk menjadi pewaris klan Sumimura. Tokine lebih tua darinya, dan dia adalah teman masa kecil sekaligus rival Kekkaishi-nya. Untuk menyelamatkan orang dari bahaya, dan untuk membuat dirinya lebih kuat, Yoshimori bertarung melawan monster.