Ketika Agen Khusus FBI Audrey Parker dikirim ke kota kecil Haven, Maine, untuk menangani kasus rutin, dia segera menemukan dirinya semakin terlibat dalam kembalinya "The Troubles", sebuah wabah gangguan supranatural yang telah terjadi di kota tersebut setidaknya dua kali sebelumnya. Dengan keterbukaan terhadap kemungkinan hal-hal paranormal, dia juga menemukan hubungan yang lebih pribadi di Haven yang mungkin membawanya kepada ibunya yang tidak pernah dia kenal. Dia dan pasangannya, detektif polisi Nathan Wuornos, sering kali menghadapi masalah yang disebabkan oleh efek dari Troubles, serta aktivitas penduduk kota yang mengambil langkah lebih drastis terhadap mereka yang terkena masalah.