Dibesarkan oleh seorang penyihir misterius setelah kematian mengerikan orang tuanya, Shiro Emiya baru saja mulai membantu orang lain menggunakan sedikit sihir yang telah dia pelajari. Namun, ketika dia tiba-tiba terjebak dalam pertarungan antara dua Magus yang lebih kuat, Shiro mendapati dirinya melakukan mantra di atas kemampuannya yang diharapkan, memanggil pejuang roh cantik Saber untuk melindunginya! Namun, keselamatan hanya bersifat sementara karena Shiro dan Saber kini terjerumus ke dalam dunia rahasia sihir gelap dan tantangan mematikan: duel tanpa batas hingga mati yang dikenal sebagai Perang Cawan Suci! Taruhannya: hadiah dengan kekuatan yang tak terbayangkan. Tapi, bisakah Shiro yang belum berpengalaman dan Saber bertahan cukup lama untuk bahkan memasuki kontes? Pertama-tama, mereka harus menahan gelombang pengkhianatan dan pembunuhan, bahkan saat Shiro berusaha keras untuk mempelajari semua yang perlu dia ketahui untuk tetap hidup saat tujuh tim Magus dan Pelayan Roh bertarung dalam pertempuran mematikan! Permainan akhir tentang kematian dan sihir terungkap saat Perang Suci meletus dalam Fate/Stay Night!