Tout juste diplômés de l'école de médecine, les nouveaux médecins John "J.D." Dorian, son meilleur ami Christopher Turk et Elliot Reid commencent leur stage à l'hôpital Sacred Heart. Là, ils rencontrent le sévère Chef de médecine Dr. Bob Kelso, le mentor réticent de J.D., Dr. Perry Cox, l'infirmière Carla Espinosa, et le concierge trompeur et farceur. L'hôpital abrite également une grande variété de personnalités parmi le personnel de Sacred Heart, y compris l'infirmière religieuse Laverne Roberts, l'avocat incompétent Ted Buckland, et la membre du conseil rancunière Jordan Sullivan, qui est aussi l'ex-femme de Cox. D'autres stagiaires se joignent à eux, comme le joyeux Todd Quinlan et le nerveux Doug Murphy. Au cours des 9 années suivantes, ils font face à des hauts et des bas personnels et professionnels, réalisant qu'ils ne peuvent pas traverser la vie - encore moins un emploi aussi mouvementé que celui de médecin - seuls.