La Division Gemini met en scène l'inspectrice sous couverture du NYPD, Anna Diaz, une policière new-yorkaise débrouillarde et endurcie, forcée de mener une double vie. La personnalité d'Anna, profondément ancrée dans son rôle sous couverture, la pousse à tenir les gens à distance, car une couverture éventée signifierait la mort. C'est alors qu'apparaît Nick Korda : après s'être isolée si longtemps, Diaz voit Korda comme étant presque trop beau pour être vrai. Anna trouve en Nick une sécurité qu'elle ne croyait pas possible, lui permettant d'abaisser ses défenses et d'être elle-même. Bien qu'elle ait des questions sur la vie de Nick, après seulement quelques mois, le couple se rend dans la romantique Paris et se fiance. Mais, avant que ses questions et sa demande en mariage ne trouvent réponse, Nick est assassiné. Diaz jure de traduire ses meurtriers en justice et, ce faisant, découvre la vérité sur Korda et une vaste conspiration mondiale. Expérimentations génétiques clandestines, opérations militaires secrètes, une mystérieuse organisation nommée la Division Gemini, et des formes de vie humanoïdes simulées. L'inspectrice Anna Diaz devra faire appel à toute son expérience pour découvrir la vérité et survivre.