Situé sur une Terre future, Defiance plonge les joueurs et les spectateurs dans un monde où les humains et les extraterrestres cohabitent sur une planète ravagée par des décennies de guerre et transformée par des machines de terraformation extraterrestres. L'histoire se concentre sur Jeb Nolan, le gardien de la loi dans une ville frontalière en plein essor, l'une des rares oasis de civilité et d'inclusion du nouveau monde. Nolan est un ancien Marine qui a combattu dans le conflit extraterrestre et a perdu sa femme et son enfant durant la guerre. Ce traumatisme l'a transformé en un vagabond solitaire dans les contrées sauvages de ce nouveau monde dangereux.