Inspiré par le film à succès classique, qui a célébré son 20e anniversaire en 2015, 12 Monkeys explore l'histoire provocante d'un voyageur temporel venant d'un futur dévasté dans une course contre la montre à enjeux élevés. Utilisant une méthode de voyage dans le temps dangereuse et non testée, il voyage de 2043 à nos jours dans le but de localiser et d'éradiquer la source d'une peste mortelle qui anéantira presque entièrement l'humanité.