Whiskey Cavalier sigue las aventuras del agente del FBI Will Chase (nombre en clave: Whiskey Cavalier) quien, tras una ruptura sentimental, es asignado a trabajar con la agente de la CIA Francesca "Frankie" Trowbridge (nombre en clave: Fiery Tribune). Juntos, lideran un equipo interinstitucional de espías que periódicamente salvan el mundo (y se salvan mutuamente) mientras navegan por los difíciles caminos de la amistad, el romance y la política de oficina.