Während eines routinemäßigen U-Boot-Tauchgangs entdeckt die Ozeanografin Laura Daughtery eine unbekannte Lebensform und deckt eine Regierungsvertuschungsoperation auf, die von dem Wissenschaftler Dr. Aleksander Cirko geleitet wird. Unterdessen verliert der Fischer Richard Beck aus Louisiana seinen Bruder bei einem verdächtigen Tauchunfall, und ein junger Junge namens Miles schleicht ein ungewöhnliches aquatisches Ei in sein Zuhause. Vom Südatlantik und dem Golf von Mexiko bis nach San Diego und Monterey lauert etwas unter der Oberfläche.