Inspiriert vom Blockbuster-Kinofilm und seinen beiden beliebten Fernseh-Spin-offs: Stargate: SG-1 und Stargate: Atlantis, erkundet Stargate: Infinity das Universum weiter durch die Augen jener wenigen, die mutig genug sind, sich durch das mysteriöse Sternentor zu wagen. Diese Zeichentrickserie schildert eine Generation, nachdem das SGC zum ersten Mal durch das außerirdische Gerät, bekannt als das Sternentor, geschritten ist. Der Krieg mit den bösen, parasitären Goa'uld ist gewonnen. Das einst streng geheime Stargate Command und seine Arbeit wurden deklassifiziert, und Wesen von anderen Welten leben unter uns. Doch nun gibt es eine neue Bedrohung, und Major Gus Bonner muss eine Gruppe junger SGC-Kadetten durch das Sternentor führen, um das Leben eines Alten vor feindlichen neuen Gegnern zu schützen.