Shio Ogura, ein scheinbar normaler japanischer Oberschüler, wird während eines Schulbesuchs in Taiwan plötzlich von Monstern angegriffen. Auch Agenten, bekannt als "E-Gene Holder", von der Regierungsbehörde DOGOO, treffen ein und führen Waffen, die mit den Geistern historischer Persönlichkeiten durchtränkt sind. Doch mitten im Chaos wird enthüllt, dass Shio ebenfalls ein E-Gene Holder ist, als die Seele von Oda Nobunaga erwacht, nachdem sie versucht, einen Freund zu retten.