Die Geschichte von Hunter × Hunter dreht sich um einen jungen Jungen namens Gon Freecss, der eines Tages entdeckt, dass sein Vater, von dem er immer gesagt bekam, er sei tot, lebendig und wohlauf ist. Er erfährt, dass sein Vater, Ging Freecss, ein legendärer Hunter ist, eine Person, die sich durch eine Prüfung als Elitemitglied der Menschheit bewiesen hat, mit einer Lizenz, überall hinzugehen oder alles zu tun. Trotz der Tatsache, dass sein Vater Gon bei seinen Verwandten zurückgelassen hat, um seinen Träumen zu folgen, ist Gon fest entschlossen, in die Fußstapfen seines Vaters zu treten, die Hunter-Prüfung zu bestehen und schließlich seinen Vater zu finden, um sich selbst als Hunter zu beweisen.