تدور أحداث القصة في عالم يواصل فيه البشر حربهم ضد "المجهول" - عدو البشرية. يستيقظ أطفال تم إجلاؤهم إلى منشأة سبات عميق خلال غزو "المجهول" قبل عدة عقود من سباتهم، ويكتشفون أن أجسادهم قد طورت قوى خارقة للطبيعة. لحماية البلاد من "المجهول" الذي يخرج من بوابة خليج طوكيو، يخوض الفتيان والفتيات معارك للدفاع عن مدن طوكيو، كاناغاوا، وتشيبا.