يتبع مسلسل ناروتو عن كثب حياة فتى يخافه ويكرهه سكان قرية الورقة المخفية في كونوها. عدم الثقة في الفتى له علاقة قليلة بالفتى نفسه، بل بما بداخله هو ما يسبب القلق. قبل وقت طويل من ظهور ناروتو، كانت هناك كيوبي (ثعلب شيطاني) ذو غضب وقوة هائلة قد شنت حربًا أخذت العديد من الأرواح. استمرت المعركة لفترة طويلة حتى واجه رجل يُعرف باسم الهوكاجي الرابع، يونديم، أقوى نينجا في كونوها، الكيوبي بشجاعة. سرعان ما انتصر يونديم حيث ختم الشيطان الشرير في جسد إنسان. وهكذا وُلِد الفتى ناروتو. مع نمو ناروتو، يقرر أن يصبح أقوى نينجا في كونوها في محاولة لإظهار للجميع أنه ليس كما يظنونه، بل إنسان يستحق الحب والإعجاب. لكن الطريق نحو أن يصبح هوكاجي، اللقب المخصص لأقوى نينجا في كونوها، هو طريق طويل وشاق. إنه مسار مليء بالخيانة والألم والفقدان؛ ولكن مع العمل الجاد، قد يحقق ناروتو حلمه في أن يصبح هوكاجي.