تدور أحداث القصة في عالم موازٍ لعالم "Fate/stay night" حيث اختفى الكأس الأكبر بشكل غامض من مدينة فويوكي بعد الحرب المقدسة الثالثة. بعد سنوات عديدة من الصمت، وفي نفس الوقت تقريبًا الذي كان من المفترض أن تحدث فيه الحرب المقدسة الخامسة، تعلن عائلة "يغميلينيا" من السحرة، انفصالها علنًا عن جمعية السحرة، وتؤكد حيازتها للكأس. ترسل الجمعية خمسين ساحرًا لاستعادته، لكنهم يُقتلون جميعًا باستثناء واحد على يد خادم غامض. يتمكن الساحر الوحيد المتبقي من تفعيل نظام الكأس الأكبر الاحتياطي، مما يسمح باستدعاء أربعة عشر خادمًا في المجموع. في مدينة تريفاس، ستتقاتل فصيلتان للسيطرة على الأثر المقدس، وتمتلك كل منهما فريقها الخاص المكون من سبعة خدام: الفصيل الأسود الذي ينتمي أعضاؤه إلى "يغميلينيا"، ويحمون الكأس، والفصيل الأحمر الذي أرسل أعضاؤه من قبل جمعية السحرة، ويحاولون استعادة الكأس. لمثل هذا الحدث بهذا الحجم، يستدعي الكأس نفسه خادمه الخاص، الحاكم المقدس، للإشراف على الصراع. يمثل هذا بداية الحرب المقدسة الكبرى للكأس.