X-Men '97, kendilerini nefret eden ve korkan bir dünyayı korumak için doğaüstü yeteneklerini kullanan bir grup mutant olan X-Men'in ikonik 1990'lar dönemine geri dönüyor. Mutantlar, daha önce hiç olmadığı kadar zorlu bir mücadeleyle karşı karşıya kalıyor ve tehlikeli ve beklenmedik yeni bir gelecekle yüzleşmek zorunda kalıyor.