Samurai Jack, uzak geçmişten gelen cesur ve onurlu bir samuraydır, kabus gibi bir gelecekte hapsolmuştur. Yeminli düşmanı, kötü şekil değiştiren demon Aku tarafından terörize edilmektedir. Aku'yu bir kez ve sonsuza dek durdurabilmek için geçmişe dönüş yolunu aramaktadır.