Džejk 2.0 prati Džejka Foleja, tehničara za kompjutere u NSA, koji se transformiše u tajnog agenta nakon što ga slučajno zaraze nanoboti. Nanotehnologija koja smanjuje veličinu računara na molekularni nivo, daje mu nadljudske moći. S novim sposobnostima, može da hakuje bilo šta elektronsko i da time upravlja. Njegovo medicinsko i emotivno stanje pažljivo nadgleda doktorka Dajana Hjuz, koja je predaleko od ljudskosti za svoj posao u NSA. Boreći se sa svojim prvim zadacima u NSA, Džejk mora da se dokaže i ostvari rezultate, inače će biti zatvoren na "istraživanje".