Já se passaram 10 anos desde a fatídica batalha contra Unicron. Muitos dos Decepticons que lutaram na batalha contra Unicron uniram forças com os Autobots para minerar Energon, uma fonte de energia alternativa. Mas uma nova fonte de mal surgiu, Alpha Q, que planeja roubar o Energon dos Autobots com a ajuda de Scorponok e dos Terrorcons. Esse novo mal está tentando reviver Megatron e Unicron para reacender as velhas chamas da guerra.