Okazaki Tomoya é um estudante do terceiro ano de uma escola secundária em algum lugar do Japão e não leva seus estudos a sério. Sempre atrasado para a aula, ele é visto como um delinquente pelos outros colegas, que estão ocupados se preparando para os exames de admissão à faculdade. Não é preciso dizer que ele não tem muitos amigos próximos. No entanto, Tomoya parece não se importar — até que um dia ele conhece uma garota, Furukawa Nagisa, que está sozinha na escola porque todos os seus amigos já se formaram. "Que garota desajeitada", ele pensa a princípio. Mas conversar com ela parece natural e, enquanto a ajuda, ele conhece algumas outras garotas da escola. Embora não se importe muito com elas no início, logo ele abre seu coração à medida que se conhecem melhor.