W Watson, rok po śmierci swojego przyjaciela i partnera, Sherlocka Holmesa, z rąk Moriarty'ego, doktor John Watson wraca do kariery medycznej jako dyrektor kliniki zajmującej się leczeniem rzadkich schorzeń. Jednak stare życie nie daje mu spokoju – Moriarty i Watson mają napisać kolejny rozdział historii, która fascynuje widzów od ponad wieku. Watson to serial medyczny z silnym wątkiem śledczym, przedstawiający współczesną wersję jednego z największych detektywów w historii, który przenosi swoją uwagę z rozwiązywania zagadek kryminalnych na największą tajemnicę ze wszystkich: chorobę i sposób, w jaki zakłóca ona nasze życie.