Prime Target to historia genialnego młodego doktoranta matematyki, Edwarda Brooksa, który stoi na progu wielkiego odkrycia. Jeśli uda mu się znaleźć wzór w liczbach pierwszych, zdobędzie klucz do każdego komputera na świecie. Wkrótce zaczyna zdawać sobie sprawę, że niewidzialny wróg próbuje zniszczyć jego ideę, zanim ta się narodzi, co rzuca go na orbitę Taylah Sanders, agentki NSA, której zadaniem jest obserwowanie i raportowanie zachowania matematyka. Razem zaczynają rozwikływać niepokojącą konspirację, której Edward jest sercem.