Wiosną, gdy opadają płatki kwitnących wiśni, Yū Narukami przenosi się do Yaso Inaba, by zamieszkać z wujem i kuzynką z powodu rodzinnych okoliczności. Zapisuje się do liceum Yasogami, gdzie rozpoczyna się jego pełne wydarzeń życie szkolne. Jednak gdy w spokojnym miasteczku zaczynają dochodzić do seryjnych morderstw, Yū budzi w sobie moc swojego serca, przybierającą fizyczną formę: Personę. Wśród tych nowych tajemnic znajduje się Marie, mieszkanka alternatywnego świata, Velvet Room, która nie pamięta swojej przeszłości. Wraz z przyjaciółmi, Yū musi rozwiązać wszystkie zagadki postawione przed nim i ocalić Yaso Inaba przed dalszą przemocą.