Akcja rozgrywa się w nieco futurystycznym świecie, w którym Ziemia została najechana i toczy wojnę z obcymi z innego wymiaru, zwanymi Nova. Historia śledzi przygody japońskiego chłopca o imieniu Kazuya Aoi, który zapisuje się na szkolenie w specjalnej szkole dla genetycznie zmodyfikowanych dziewcząt zwanej Pandoras, które walczą z obcymi, oraz ich męskich partnerów, zwanych Limiters, którzy używają specjalnej mocy zwanej "zamrażaniem", aby ograniczyć mobilność przeciwnika. Główny bohater nawiązuje znajomość z niezwykłą starszą dziewczyną o imieniu Bridgette L. Satellizer, która wydaje się być najpotężniejszą Pandorą w swojej klasie, ale jeszcze nie wybrała męskiego partnera, który miałby być jej Limiterem. Pomimo ostrzeżeń wszystkich swoich przyjaciół, decyduje się zostać jej Limiterem.