Historia opowiada o Haruce Nanase, chłopcu, który zawsze uwielbiał zanurzać się w wodzie i w niej pływać. Przed ukończeniem szkoły podstawowej brał udział w turnieju pływackim wraz z innymi członkami klubu pływackiego: Makoto Tachibaną, Nagisą Hazukim i Rinem Matsuoką. Po odniesieniu zwycięstwa, każdy z chłopców poszedł w swoją stronę. Czas mijał, a w środku ich spokojnego życia w szkole średniej pojawia się Rin i rzuca Haruce wyzwanie na pojedynek, pokazując mu swoją przytłaczającą siłę. Nie chcąc, aby tak się to skończyło, Haruka ponownie zbiera Makoto i Nagisę, a także dołącza nowego członka, Rei Ryugazakiego, aby stworzyć Klub Pływacki Iwatobi High School w celu pokonania Rin.