Zainspirowany klasycznym filmem, który obchodził swoje 20-lecie w 2015 roku, 12 Małp bada prowokującą historię podróżnika w czasie z zniszczonej przyszłości w wyścigu z czasem o wysokiej stawce. Wykorzystując niebezpieczną i nieprzetestowaną metodę podróży w czasie, wyrusza z roku 2043 do współczesności, aby zlokalizować i zlikwidować źródło śmiertelnej zarazy, która niemal całkowicie zniszczy ludzką rasę.