우주 저 멀리, 머나먼 행성 사이버트론에서 치열한 전투가 벌어지고 있습니다. 그곳에서 영웅적인 오토봇과 사악한 디셉티콘이 미니콘이라 불리는 로봇들을 두고 격돌합니다. 미니콘의 힘은 트랜스포머의 전투 능력을 강화할 수 있습니다. 미니콘을 둘러싼 전투가 너무 큰 희생을 초래한다는 것을 깨달은 트랜스포머들은 거대한 함선에 미니콘들을 사이버트론에서 멀리 보냈지만, 함선이 외딴 행성에 불시착하면서 결국 오토봇과 디셉티콘의 뜨거운 라이벌 관계가 지구에서 펼쳐지게 되는 일련의 사건들이 시작됩니다. 지구에 도착한 미니콘을 둘러싼 전투는 다시 시작되고, 오토봇은 디셉티콘이 은하계를 지배하기 위해 그 힘을 사용하기 전에 귀중한 "스마트 툴"을 모두 찾아내려는 그들의 탐구에 새로운 인간 동맹을 얻게 됩니다. 하지만 전투가 격렬해질수록, 거대한 행성 파괴자 유니크론이라는 더 큰 악이 그림자 속에 도사리고 있습니다...