썬더버드가 간다!! 2065년, 다수의 백만장자 제프 트레이시가 비밀 조직을 결성했다. 팀은 그의 5명의 아들과 엔지니어 브레인스로 구성되어 있다. 그의 할머니 키라노와 틴틴도 가족과 함께 살고 있다. 그들은 남태평양 어딘가에 위치한 트레이시 섬에 살고 있다. 이 조직에는 많은 비밀 첩보원이 있으며, 특히 레이디 페넬로페와 노지 파커가 있다. 두 사람은 런던의 한 대저택에 살고 있다. 스콧 트레이시는 썬더버드 1을 조종한다. 이 우주선은 정찰선과 같다. 썬더버드 2는 버질 트레이시가 조종하며, 이 우주선은 썬더버드 4를 포함한 모든 구조 장비를 운반한다. 썬더버드 3은 앨런, 존, 때때로 스콧이 조종하며, 이 우주선은 썬더버드 5와 우주 구조 작업 간의 페리 역할을 한다. 썬더버드 4는 고든 트레이시가 조종하며, 이 우주선은 수중 구조 작업을 위해 설계되었다. 썬더버드 5는 우주에 있는 우주 정거장으로, 존과 앨런이 월별 교대로 모니터링한다.