일상적인 잠수작업 중, 해양학자 로라 도터리는 미지의 생명체를 발견하고 과학자 알렉산더 시르코 박사가 이끄는 정부의 은폐 작전을 파헤친다. 한편, 루이지애나의 어부 리차드 벡은 의심스러운 잠수 사고로 형을 잃고, 한 소년 마일스는 이상한 수중 알을 집으로 몰래 가져온다. 남극해와 멕시코만, 샌디에이고와 몬터레이에 이르기까지, 수면 아래에는 뭔가 숨겨져 있다.