ワンダーラは、ロボットの世話係であるマザーに、最新鋭の地下シェルターで育てられた、好奇心旺盛で熱意にあふれ、元気いっぱいのティーンエイジャー、エヴァを中心に描かれます。16歳の誕生日、エヴァのシェルターが襲撃され、彼女は地球の地表へと追いやられます。そこは、エイリアンが住み着き、異世界の動植物に覆われた世界となっており、他の人間はどこにも見当たりません。実は、そこはもはや地球とは呼ばれず、オルボナと呼ばれていました。エヴァとテレパシー能力を共有する愛らしい巨大クマムシのオットーと、問題を抱えた過去を持つ気難しいエイリアンのロベンダーがエヴァに加わり、人間、故郷、そして真の運命を探す危険な探求の旅にチームを率いていきます。