大ヒット実写映画の物語を引き継いだ本作。スーパーヒーロー、ピーター・パーカーと、親友のハリー・オズボーン、メリー・ジェーン・ワトソンが、エンパイア・ステート大学での大学生活初年度を送る姿を描く。ピーターは、学業、デイリー・ビューグル紙のウェブデザイナー兼カメラマンとしての仕事、そして人生最愛の人との、くっついたり離れたりする関係を両立させながら、世界をスーパーヴィランから守るために戦わなければならない。