宗教的対立によって地球は引き裂かれ、人類は絶滅の淵に立たされていた。そんな中、無神論者のアンドロイド建築家は、自らの創造物であるマザーとファーザーに、惑星ケプラー22bに平和で神なきコロニーを築くよう命じる。 『レイズド・バイ・ウルブズ』は、マザーとファーザーが、この神秘的な未開の地で人間の子供たちを育てる試みに焦点を当てる。しかし、その危険で困難な任務は、生き残った人間たちの熱狂的な宗教集団、ミトラ教徒の到来によって脅かされる。狂信的で危険な彼らと接触する中で、アンドロイドたちは、自らの意志を強く持つ子供たちの信仰心をコントロールしようと奮闘する。