15歳のアミーは、「コートヤード」という殺し屋養成学校に弟子入りするため、4人の殺し屋を始末する。この秘密組織の監督は「ザ・ファーザー」。アミーは他の子供たちと共に、様々な武器の習得、殺戮マシンの養成、そして生き残る術を学ぶ。しかし、アミーはコートヤードと両親の悲惨な死との間に繋がりがある証拠を発見する。