ビリー・ディリーのスーパー・デューパー・サブタレニアン・サマーは、科学好きの小学6年生ビリー・ディリーと、夏休みに地球の核にある奇妙な世界に閉じ込められてしまう彼のラボ仲間、ジークとマーシャの冒険を追います。